Tenk hvis verden slik vi kjenner den bare er en illusjon, og vår virkelighet egentlig er en datasimulering? Den kritikerroste filmregissøren Rodney Ascher tar med seg det spørsmålet ned i et kaninhull av vitenskap, filosofi og konspirasjonsteorier. A Glitch In The Matrix søker svarene på de spørsmålene som er nærmest umulig å stille om vår eksistens, gjennom populærkulturelle referanser, vitenskapelige funn og mennesker som kan vitne om at de med all sikkerheten har opplevd "bugen i matrix".