Orson Welles esittää Yhdysvaltoihin paennutta pahamaineista natsitiedemiestä Franz Kindleriä. Tiedemies Kindler on muuttanut amerikkalaiseen pikkukaupunkiin, hankkinut uuden henkilöllisyyden ja toimii opettajana. Tiedustelupalvelu on kuitenkin hänen jäljillään. Parhaasta alkuperäiskäsikirjoituksesta Oscar-ehdokkuuden napannut Muukalainen katosi on yksi ensimmäisiä toisen maailmansodan hirveyksiä käsitelleistä valtavirtaelokuvista.